内坛主要是与四圣六凡交流，是整个水陆的心脏。内坛法事的先后次第如下：
结界洒净：皈命三宝，恭请诸佛降临护持道场。结“地方界”、“方隅界”、“虚空界”，明确规划出坛场用地。结界范围内有护法诸天守护，闲杂人等不得污犯，令坛场内外清净。从水陆首日三更天开始，先在外坛洒净，四更天于内坛结界。结界洒净后道场开启，众圣将临，当须内外净洁，洒净后金刚为墙，琉璃为地、宝幢为华。洒净结界后坛内行止有禁，不得高声戏笑。
发符悬幡：在首日五更天时，派遣使者建幡，昭请众圣神灵，昭告人天佛事将启。使者手持符牒、疏文，往天、空、地、冥昭请众圣神灵。升扬宝幡，高悬于大雄宝殿左前方的刹竿上，昭告人天。宝幡上书写：启建十方法界四圣六凡水陆普度大斋胜会功德宝幡。
奉请上堂：在次日的四更天，请参与内坛的高僧上堂，五更天奉浴。恭请诸佛菩萨、 缘觉、声闻、明王、婆罗门仙、梵王帝释，历代祖师，一切尊神等众降临坛场。
奉供上堂：备斋筵、香花、灯、食衣、珍宝、法等，是为六尘妙供，如法供养。
奉表告赦：为悲悯六道，五更天告达司事天神，祈求赦放被禁六道群灵莅临法会听经闻法，除患得安。
召请下堂：六道既赦，众苦皆离，可赴盛会。第四日三更天请下堂高僧，四更天奉浴，五更天说戒。
受幽冥戒：召请五岳河海大地鬼神、地狱众生诸鬼神众受幽冥戒、六凡众生等，来受法味饮食，同沾法益。授以一切鬼神六道受苦众生戒法，将夙昔所造的一切恶业经由忏悔而清净，可速往无量光明佛刹。
奉供下堂：受戒以后，得清净识，得以入坛坐列，安享法味。第五日四更天，诵《信心铭》，五更天时，供养下堂高僧，午时斋僧。准备美味素斋，宴请六道群灵，并为其诵阿弥陀经及念佛。
放生：在第六日的四更天，主法和尚亲祝上下堂众僧，午前举行放生的仪式。
供僧及送圣：第七日五更天，普供上下堂众僧，午时斋僧，未时迎请上下堂至外坛。（圆满供：一齐斋供圣凡廿四席，法味滋神，六道群灵欢欣交畅。圆满香：胜会即将圆满，六道众生趁此出离苦海永不沉没。）为所有参加水陆法会的群灵说法、加持、供养后，回向使他们往生西方极乐世界。当接引亡灵同归极乐的西方船在袅袅香烟中燃起，水陆法会就此圆满。申时恭送诸佛菩萨及圣贤等众。
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